2022年10月12日，交通运输部下发了《交通运输部办公厅关于公布综合交通运输理论交通运输行业重点实验室认定名单的通知》（交办科技函〔2022〕1430号），交通运输学院朱晓宁教授牵头组建，由北京交通大学、国家发展和改革委员会综合运输研究所、长安大学、南京航空航天大学四家交通运输行业高校和科研院所构成的联合体，被正式认定为综合交通运输理论交通运输行业重点实验室，朱晓宁教授担任实验室主任。

该实验室是唯一一家高校牵头通过交通运输部认定的综合交通运输理论行业重点实验室，该实验室的成功申报为我校建设特色鲜明世界一流大学、推进交通强国建设试点工作以及国家高端智库建设提供了重要的平台支撑。

实验室围绕交通强国建设和现代化高质量国家综合立体交通网构建，重点从综合交通运输基础理论、综合交通运输应用理论、综合交通运输共性关键技术三个方面突破相关理论、方法及技术，构建具有中国特色的综合交通运输理论体系，建设成为综合交通运输理论的创新平台，提升我国综合交通运输理论水平；建设成为支撑综合交通运输发展的高端智库，为我国综合交通运输系统高质量发展提供理论支撑；建设成为拔尖创新型人才的培养基地，为我国的交通强国建设培养综合交通运输高端人才。